地下大洞窟

　結界で隔離されたど田舎に住んでいる『ムツヤ』。彼は裏庭の塔が裏ダンジョンだと知らずに子供の頃から遊び場にしていた。 　裏ダンジョンで鍛えた力とチート級のアイテムと、アホのムツヤは夢を見て外の世界へと飛び立つが、早速オークに捕らえられてしまう。 　そこで知る憧れの世界の厳しくも残酷な現実とは……？

ある日世界に突如として異次元への「ゲート」が現れた。その扉の向こうに広がるのは「ダンジョン」と呼ばれる異質な世界。ダンジョンという現象の出現に伴い、ダンジョンを攻略し、その消失を生業とする「ダンジョンクリーナー」たちが現れた。いまいち社会に溶け込めずどこか疎外感を抱いていた主人公「水瀬　優」は苦悩の末、ダンジョンクリーナーを目指すことになる。超常の力が交錯するダンジョン。そこを生き抜く人々の物語であり、これは……彼の神話だ。

　かつて大地には、高度な文明を築き栄えた国があった。 　科学者達は、長く続く争いを無くそうと人々の善と悪の思念を制御する研究を続けてきた。 　そしてついに、それらを別の空間に蓄積し隔離する術を生み出した。 　しかし、その思念は人の手に負えぬほど膨張、暴走し、二つの異なる次元は全ての生命を飲み込んだ。 　二つの次元はそれぞれ「魔」と「天」と呼ばれた。 　魔と天のコメディバトルここにあり！

明治四十一年、秋。植物学者・神坂修五郎は、稀代の園芸家・鏡見久我が建設した「硝子庭園」の内覧会に招かれた。七つの区画に分かれたその庭園には、世界中から集められた有毒植物が配置され、精巧に計算された硝子の屈折が、万華鏡のような美を生み出していた。 翌朝、園芸師・柊木の遺体が中央区画で発見される。完全な密室。死因はストリキニーネ中毒。しかし現場には不可解な点が多すぎた──なぜ彼は扉を内側から施錠したのか？　なぜ足跡が不自然なのか？ 調査を進める神坂は、植物配置に隠された驚くべき暗号に気づく。錬金術の象徴「ヘルメスの薔薇十字」。そして光の屈折が創り出す「幻の植物」。暗号が示すのは不老不死の霊薬か、それとも──？

　御影町に住む高校生・小鳥遊成海は、幼い頃から幽霊や怪異が「視える」体質を持つ。 　ある日、正体不明の化け物に追いかけられ、命の危機に陥ったところを、謎めいた和服の男・店主に助けられる。 　『奇縁堂』。 　そこには個性豊かな面々が暮らしている。 　一人暮らしをしながら自立を保ってきた成海は当初距離を置こうとするが、一緒に食事をし、語り合ううちに、じわじわと奇縁堂の日常に溶け込んでいく。 　 　そんな奇妙な日々の後、成海の通う高桜高校で、三年生の女子生徒が北校舎の窓から飛び降りるという事件が起きる。

広樹はある日、知らない女の悲鳴を聞く。だが、外に出ても何もない。 家に入り再び眠りにつこうとするが、また、女の声がして眠れない。声のする方へ出てみると廊下には知らない女がいる。 広樹は女の悲鳴を聞いた次の日、女に連れられ裏世界に来てしまう。裏世界で広樹に下された使命。それは裏世界を動かす迷路ゲームをクリアする事だった。そのゲームはいたってシンプル。だがクリアした者は誰一人としていない。 裏世界の住人に頼まれ、広樹は断れずにゲームに参加することになった。 そのゲームは気分が悪くなることが起こり、嫌なことばかりが起こる。 たくさんの奇妙な生き物が出てくる。 そんな中、広樹は一つのダイヤを探す。