Photoshopは長年愛用しているデジタルペイントツールの定番ですね。レイヤー機能やブラシのカスタマイズ性が特に優れていて、細かいタッチの調整から大胆な色使いまで自由自在です。
最近はClip Studio Paintにもハマっていて、漫画制作に特化した機能が豊富。トーンや集中線の素材ライブラリが充実しているので、効率よく作業を進められます。ベクター機能で線画を後から調整できるのも地味に便利。
有料ソフトの話ばかりですが、実は無料のKritaも侮れません。オープンソースながらブラシエンジンの性能が高く、自然な水彩表現が得意。初期設定のブラシ種類が豊富なのも初心者に優しいポイントです。